Program Magister

Program Pascasarjana Universitas Atma Jaya Yogyakarta memiliki sejumlah Program Studi didalamnya yaitu:

1. Program Studi Magister Manajemen
2. Program Studi Magister Teknik Sipil
3. Program Studi Magister Ilmu Hukum
4. Program Studi Magister Teknik Informatika
5. Program Studi Magister Arsitektur
6. Program Studi Magister Ilmu Komunikasi
7. Program Studi Magister Teknik Industri